Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms