Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms