Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms