Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms