Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms