Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms