Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms