Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LCORQ96JN0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms