Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHDQ96IW2 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms