Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIPA1Q96FS4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms