Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms