Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms