Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL2Q969S2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL2Q969S2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL2Q969S2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL2Q969S2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL2Q969S2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms