Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3CQ92520 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms