Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms