Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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ZNF548Q8NEK5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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ZNF548Q8NEK5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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ZNF548Q8NEK5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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