Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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TTC21AQ8NDW8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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TTC21AQ8NDW8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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TTC21AQ8NDW8 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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TTC21AQ8NDW8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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TTC21AQ8NDW8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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