Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms