Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms