Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms