Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms