Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms