Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBR1LQ6UX01 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms