Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms