Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms