Protein–RNA interactions for Protein: Q6IN84

MRM1, rRNA methyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRM1Q6IN84 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRM1Q6IN84 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms