Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM225Q6GV28 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM225Q6GV28 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM225Q6GV28 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM225Q6GV28 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM225Q6GV28 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM225Q6GV28 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM225Q6GV28 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM225Q6GV28 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM225Q6GV28 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM225Q6GV28 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM225Q6GV28 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM225Q6GV28 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM225Q6GV28 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM225Q6GV28 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM225Q6GV28 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM225Q6GV28 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM225Q6GV28 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM225Q6GV28 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM225Q6GV28 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM225Q6GV28 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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