Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIGD3Q6B0B8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms