Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VIRMAQ69YN4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms