Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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