Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEXMIFQ5QGS0 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms