Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms