Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SGO1Q5FBB7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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