Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms