Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms