Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 APOL3-205ENST00000397293 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 LAMB1-203ENST00000393560 2806 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms