Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN52Q52LA3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN52Q52LA3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms