Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PFKFB3Q16875 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
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PFKFB3Q16875 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PFKFB3Q16875 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PFKFB3Q16875 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PFKFB3Q16875 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PFKFB3Q16875 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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