Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CA9Q16790 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CA9Q16790 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CA9Q16790 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CA9Q16790 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CA9Q16790 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CA9Q16790 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CA9Q16790 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CA9Q16790 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CA9Q16790 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CA9Q16790 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CA9Q16790 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CA9Q16790 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CA9Q16790 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CA9Q16790 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CA9Q16790 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CA9Q16790 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CA9Q16790 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CA9Q16790 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CA9Q16790 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CA9Q16790 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CA9Q16790 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CA9Q16790 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CA9Q16790 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms