Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
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ECM1Q16610 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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ECM1Q16610 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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ECM1Q16610 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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