Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK5Q16478 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms