Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SSX1Q16384 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SSX1Q16384 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SSX1Q16384 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SSX1Q16384 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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