Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms