Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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