Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms