Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF11Q15544 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms