Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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