Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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