Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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