Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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